7月1日,华南农业大学教授吴珍芳团队初次提醒了不同代谢类型猪骨骼肌的染色质空间构象及其介导的调控差异,经过整合表观基因组学与三维基因组学剖析并结合分子试验,阐明晰超级增强子调控肌纤维类型分解与转化的分子机制。相关效果发表于《天然-通讯》(
该研讨使用瘦肉型杜洛克猪的氧化型比目鱼肌(SOL)和酵解型趾长伸肌(EDL)为研讨目标,经过联合染色质免疫共沉淀(ChIP-seq)及高通量染色质构象捕获测序(Hi-C)等多组学测序技能,体系解析了超级增强子(SE)介导染色质三维互作调控肌纤维类型定向分解及转化的功用及机制。这不只为猪肉质量改进供给了新的育种靶点,也为使用功用位点骤变技能定向调控肌纤维类型份额供给了理论基础。
该研讨经过制作氧化型比目鱼肌和酵解型趾长伸肌的顺式调控元件及染色质三维构象精密图谱,构建了与肌肉缩短和氧化代谢相关的特异增强子-启动子-转录因子调控网络,提醒了超级增强子经过直接结合启动子近端区域或介导染色质环远端互作,激活肌纤维类型决议基因MYH4和MYH7的表达,终究调控肌纤维类型的分解方向
该研讨经过整合多组学剖析及分子试验,初次在细胞和小鼠活体水平体系提醒了STARD7基因促进酵解型向氧化型肌纤维转化的功用,并进一步在机制上验证STARD7经过下降活性氧水平缓按捺ERK信号通路促进肌纤维向氧化型转化,其自身基因表达受超级增强子介导的染色质环调控。
该研讨结果不只有助于树立畜禽肉质改进新技能,也为人类肌肉代谢疾病医治供给了学习。
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